Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPRSS11EQ9UL52 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms