Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXW11Q9UKB1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms