Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms