Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCF2Q9UG63 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms