Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms