Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJB4Q9UDY4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms