Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms