Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUCLA2Q9P2R7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms