Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms