Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRO2289Q9P1D8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
PRO2289Q9P1D8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
PRO2289Q9P1D8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -1
PRO2289Q9P1D8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PRO2289Q9P1D8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PRO2289Q9P1D8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PRO2289Q9P1D8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PRO2289Q9P1D8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PRO2289Q9P1D8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
PRO2289Q9P1D8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms