Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAK1IP1Q9NWT1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAK1IP1Q9NWT1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms