Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSDC1Q9NW68 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms