Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PARVAQ9NVD7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PARVAQ9NVD7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PARVAQ9NVD7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PARVAQ9NVD7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PARVAQ9NVD7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms