Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG3Q9NT62 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms