Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms