Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms