Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKN1Q9NS71 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GKN1Q9NS71 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms