Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4BQ9NPR2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms