Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRMS1Q9HCU9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms