Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNRC6CQ9HCJ0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms