Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSER2Q9H7U1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSER2Q9H7U1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCSER2Q9H7U1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCSER2Q9H7U1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCSER2Q9H7U1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCSER2Q9H7U1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCSER2Q9H7U1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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