Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA6BQ9H3T3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms