Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL11BQ9C0K0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL11BQ9C0K0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms