Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL4Q9C0H6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms