Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM7Q9C029 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms