Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP1Q9C000 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms