Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFIH1Q9BYX4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms