Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms