Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms