Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms