Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX50Q9BQ39 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms