Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms