Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIN2AQ99865 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms