Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HHIPQ96QV1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HHIPQ96QV1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms