Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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TRNT1Q96Q11 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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