Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85AQ96PX6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85AQ96PX6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms