Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD4LQ96PU5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms