Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms