Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms