Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms