Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPL1Q96JK4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPL1Q96JK4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPL1Q96JK4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPL1Q96JK4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPL1Q96JK4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPL1Q96JK4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPL1Q96JK4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPL1Q96JK4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPL1Q96JK4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPL1Q96JK4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPL1Q96JK4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPL1Q96JK4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPL1Q96JK4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms