Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM11Q96F44 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM11Q96F44 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM11Q96F44 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM11Q96F44 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM11Q96F44 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM11Q96F44 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM11Q96F44 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM11Q96F44 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TRIM11Q96F44 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TRIM11Q96F44 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TRIM11Q96F44 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TRIM11Q96F44 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TRIM11Q96F44 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM11Q96F44 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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