Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP36Q96EU6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP36Q96EU6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms