Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EAF2Q96CJ1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms