Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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FAM3DQ96BQ1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM3DQ96BQ1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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FAM3DQ96BQ1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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FAM3DQ96BQ1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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