Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA18Q8TC71 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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SPATA18Q8TC71 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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