Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF397Q8NF99 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF397Q8NF99 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms