Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL3Q8ND23 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms