Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC191Q8NCU4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms