Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDPRQ8NCN5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms